福建永安市辣椒丛枝病植原体的分子检测及鉴定

编号 zgly0001493950

文献类型 期刊论文

文献题名 福建永安市辣椒丛枝病植原体的分子检测及鉴定

作者 刘建密  纪翠红  陈细红  林积秀  黄培枝  严叔平  陈文乐  陈彩霞  张宇翔  牟海青 

作者单位 福建三明市植保植检站  福建永安市植保植检站  福建厦门出入境检验检疫局  中国检验检疫科学研究院 

母体文献 植物保护 

年卷期 2015年03期

年份 2015 

分类号 S436.418.1 

关键词 辣椒  植原体  16SrDNA  巢式-PCR  系统进化分析 

文摘内容 永安地区发病辣椒植株表现小叶、黄化、丛枝、簇芽等症状。利用植原体16SrDNA基因的通用引物R16mF2/R16mR2和R16F2n/R16R2,对发病辣椒植株总DNA进行巢式PCR检测,获得约1.2kb的特异性DNA片段。经测序并在GenBank数据库进行比对分析,共获得4条植原体特定的16SrDNA基因序列(CHY-C4-1、CHYY1-1、CHY-Y7-1、CHY-G1-1)。将测得的4条序列与已报道的植原体序列进行同源性比对,并构建系统进化树,结果显示获得的4条植原体序列均聚类到16SrI组,其中CHY-Y1-1、CHY-Y7-1、CHY-G1-1与16SrI-B亚组植原体聚类到同一支,而CHY-C4-1与已报道的16SrI组内的6个亚组均未聚类到一支,因此建议将CHY-C4-1命名为新的亚组。利用iPhyClassifier在线分析软件对获得的4条植原体序列进行虚拟RFLP分析,结果与进化树获得的结果一致。