基于RNA-Seq的雌蕊缺失茶树花转录组分析

编号 zgly0001566262

文献类型 期刊论文

文献题名 基于RNA-Seq的雌蕊缺失茶树花转录组分析

作者 夏丽飞  陈林波  李梅  宋维希  田易萍  蔡丽  杨意坚  江昌俊 

作者单位 云南省农业科学院茶叶研究所  云南省茶树种质资源创新与配套栽培技术工程研究中心  安徽农业大学茶树生物学与资源利用国家重点实验室 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2017年03期

年份 2017 

分类号 S571.1 

关键词 茶树  雌蕊缺失  转录组  RNA-seq  基因注释 

文摘内容 茶树是重要的叶用经济作物,但是茶树每年都要开花结实,消耗大量的养分,导致茶树鲜叶产量减少和品质降低。雌蕊缺失茶树资源是天然的不结实茶树品种。采用Illumina Hi Seq TM 2 500高通量测序技术,对雌蕊缺失茶树花花芽、花蕾、花进行转录组分析。经组装获得237 484条Transcripts,取最长Transcripts作为Unigene,有182 123条,将获得的Unigene与Nr、Nt、Pfam、KOG/COG、Swiss-prot、KEGG、GO等七种数据库进行注释,有22 049条Unigene被注释上26种KOG分类,注释到KEGG的Unigene条数为21 315,涉及的pathway有130条。此外,发掘出与花器官形态建成的ABCDE模型的功能基因31个,这些注释信息的完成为茶树花器官发育基因及性别决定相关基因的发掘提供了重要依据。