辣椒全基因组中CBL、CIPK基因家族的鉴定及特性分析

编号 zgly0001566448

文献类型 期刊论文

文献题名 辣椒全基因组中CBL、CIPK基因家族的鉴定及特性分析

作者 刘思源  黄海锋  王旭东  宫超  宋海慧  陈秀玲  王傲雪 

作者单位 东北农业大学园艺园林学院  东北农业大学生命科学学院 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2017年08期

年份 2017 

分类号 Q943.2  S641.3 

关键词 辣椒  CBL基因家族  CIPK基因家族  遗传进化 

文摘内容 CBL、CIPK作为钙离子介导的信号转导通路上的重要蛋白在植物逆境应答和生长发育过程中发挥着重要的作用。本研究通过本地t BLASTn鉴定出辣椒中CBL、CIPK基因家族成员序列信息;运用MEGA程序构建系统进化树;利用GSDS程序对基因结构保守性进行分析、MEME程序进行基序分析以及UGENE、plant CARE软件对顺势作用元件进行了分析,显示9个辣椒CBL基因,21个辣椒CIPK基因分别分布于不同的染色体上,Ca CBL基因内含子个数保守为79个;Ca CIPK基因分为多内含子（1114）和少内含子（01）两类。在辣椒CBL基因和CIPK基因的上游1 000 bp序列中存在多个应答不同逆境和植物激素的顺式作用元件且种类和数目各不相同。相互作用预测发现,辣椒CBL-CIPK可能存在多个相互作用通路。本研究可为进一步研究辣椒CBL、CIPK基因的功能以及辣椒中CBL-CIPK介导的Ca2+信号转导通路提供有益参考。