短期盐胁迫下盐穗木的转录组分析

编号 zgly0001577703

文献类型 期刊论文

文献题名 短期盐胁迫下盐穗木的转录组分析

作者 张丽丽  张富春 

作者单位 新疆大学生命科学与技术学院  新疆生物资源基因工程重点实验室 

母体文献 植物研究 

年卷期 2018年01期

年份 2018 

分类号 Q943.2 

关键词 盐穗木  盐胁迫  转录组  差异基因  渗透调节  活性氧 

文摘内容 盐穗木（Halostachys caspica）是荒漠盐碱地广泛分布的盐生植物,具有极强的耐盐性。为揭示盐胁迫下盐穗木基因组层面的基因表达变化特性,通过对300和500 mmol·L-1Na Cl胁迫3 h的盐穗木同化枝进行了转录组测序。有效序列组装共得到153 298条平均长度为643 bp的unigenes,进行GO和KEGG功能聚类,分别获得47个GO功能小类和118个KEGG通路。差异表达基因分析显示,短期低盐(300 mmol·L-1)响应基因有4 432个,高盐(500 mmol·L-1)响应基因有2 580个,两个胁迫的共差异基因有1 245个,主要富集在细胞过程、代谢过程和响应刺激等类别中。从短期盐胁迫下盐穗木转录组筛选出渗透调节和活性氧清除的相关基因,大多为上调基因。说明盐穗木能够通过促进渗透调节和增强活性氧清除提高短期的盐胁迫适应能力。