生物陶粒与生物活性炭上微生物群落结构的PCR-SSCP技术解析

编号 zgly0000495665

文献类型 期刊论文

文献题名 生物陶粒与生物活性炭上微生物群落结构的PCR-SSCP技术解析

作者 刘小琳  刘文君 

作者单位 清华大学环境科学与工程系 

母体文献 环境科学 

年卷期 2007,28(4)

页码 924-928

年份 2007 

分类号 X172 

关键词 生物陶粒  生物活性炭  微生物群落  群落结构  单链构象多态性 

文摘内容 采用PCR—SSCP(单链构象多态性)技术, 以16SrRNA基因的V4-V5区为靶对象, 分析用于饮用水处理的生物陶粒和生物活性炭上的微生物群落结构。对生物陶粒和生物活性炭上的微生物分别进行超声波洗脱、R2A和LB平板培养后提取基因组DNA.结果表明, 除生物活性炭超声波洗脱不能提取到DNA外, 其他处理均能提取到大小在10kh以上的基因组DNA, 但所提取的量有较大差异。以提取的DNA为模板分别进行PCR, 均能扩增到408bp的基因片段。这些片段经A核酸外切酶消化处理后进行SSCP电泳。结果显示, 超声波洗脱、R2A和LB培养对试验结果影响不明显。生物陶粒的微生物基因扩增片段SSCP图谱相同。且只出现1条带。测序后与基因组数据库对比, 结果显示其与uncultured Pseudomonas sp.clone FTL201 16S rDNA(GenBank登录号AF509293.1)片段同源性为92%.生物活性炭的微生物基因扩增片段SSCP图谱也相同, 但有2条带。测序对比的结果表明, 这2个基因片段与Bacillus sp.JH19 16S rDNA(GenBank登录号DQ232748.1)片段和Bacterium VA—S-11 16S rDNA(GenBank登录号AY395279.1)片段的同源性分别为100%和99%。