甜瓜SSR标记在葫芦科不同作物间的通用性分析

编号 zgly0001639781

文献类型 期刊论文

文献题名 甜瓜SSR标记在葫芦科不同作物间的通用性分析

作者 宋金亮  杨路明  郭禄芹  朱华玉  朱磊  胡建斌  孙守如 

作者单位 河南农业大学园艺学院 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年12期

年份 2018 

分类号 S652 

关键词 甜瓜  葫芦科  SSR  通用性  遗传多样性 

文摘内容 微卫星标记(SSR)在近缘物种间具有通用性,因其高效率、低成本可广泛用于跨物种间的遗传多样性分析、基因定位和图谱构建等。本试验基于甜瓜基因组测序结果开发了120对SSR标记,研究其在8种葫芦科作物间的通用性及作物内的多态性,并利用NTSYS软件分析37份不同瓜类作物材料间的遗传多样性。结果显示,114对标记均在甜瓜基因组中得到有效扩增,黄瓜中有108对标记有效扩增,通用性比率为94.7%,南瓜中能有效扩增标记最少,其通用性比率也达到了41.2%,在8种葫芦科作物间均通用的标记有29对;通过对通用性标记的多态性分析表明,甜瓜多态性比率最高为61.4%,西瓜、黄瓜、苦瓜、冬瓜、西葫芦、南瓜和丝瓜多态性比率分别为32.5%、14%、4.4%、8.8%、3.5%、13.2%和11.4%;不同作物间的平均遗传相似系数在0.70~0.83之间,其中甜瓜和黄瓜平均遗传相似系数较小,亲缘关系较近,西葫芦和南瓜间的平均遗传相似系数最小,亲缘关系最近。这些通用性标记将有利于提高葫芦科作物整体分子生物学研究水平。