双孢蘑菇胞外分泌蛋白质组的功能预测及分析

编号 zgly0001553564

文献类型 期刊论文

文献题名 双孢蘑菇胞外分泌蛋白质组的功能预测及分析

作者 刘旭影  阮心眉  程凡升  李文香  朱丹 

作者单位 青岛农业大学食品科学与工程学院  青岛农业大学生命科学学院 

母体文献 食用菌学报 

年卷期 2017年03期

年份 2017 

分类号 S646 

关键词 双孢蘑菇  胞外蛋白  生物信息学  功能注释  酶学分类 

文摘内容 以双孢蘑菇(Agaricus bisporus)10448个蛋白为研究对象,综合利用信号肽分析软件SignalP 4.1、跨膜结构预测软件TMHMM v2.0、GPI锚定位点预测软件big-Pi Predictor以及亚细胞蛋白定位软件TargetP1.1等生物信息学软件,筛选双孢蘑菇胞外分泌蛋白质序列,使用分析软件BLAST2GO进行功能注释。筛选得到469个胞外分泌蛋白质序列,统计发现编码这些蛋白质的开放阅读框(open reading frame,ORF)最长为4800bp,平均为1233bp。除去假定蛋白质,双孢蘑菇胞外分泌蛋白质的生物代谢途径主要有生物大分子代谢(22.2%)、碳水化合物代谢(17.4%)、脂质代谢(3.2%)、芳香化合物代谢(2.2%)等。同时,共发现133种酶类,其中包括糖苷水解酶(38.5%)、多铜氧化酶(7.4%)、肽酶(7.0%)、果胶裂解酶(4.0%)和羧酸酯酶(2.9%)等。