棉铃虫膨胀线粒体基因组的鉴定与分析

编号 zgly0001659579

文献类型 期刊论文

文献题名 棉铃虫膨胀线粒体基因组的鉴定与分析

作者 张屾  谷少华  李显春 

作者单位 中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室  亚利桑那大学昆虫系 

母体文献 植物保护 

年卷期 2019年01期

年份 2019 

分类号 S433.4 

关键词 棉铃虫  线粒体基因组  膨胀  RNA解旋酶  转座子 

文摘内容 以已公布的棉铃虫线粒体DNA序列对来自4头棉铃虫雄蛹的DNA的三代测序数据进行筛选,获得了11条与线粒体DNA有同源性的三代read序列,并根据其中的read 66003鉴定出了一种膨胀的线粒体基因组。该线粒体基因组大小为27 113 bp,其保守区域包含13个蛋白编码基因、2个rRNA基因、22个tRNA基因以及1个AT富集区,与已公布的棉铃虫线粒体基因组的结构相似。膨胀区域位于cox1基因编码区内部,大小为11 467 bp,经预测含有一个完整的真核基因(依赖ATP的RNA解旋酶)以及多种转座元件的片段,但与线粒体DNA无同源性,也无I类或Ⅱ类内含子存在的证据。对田间和室内棉铃虫DNA样品的PCR扩增未能检测到膨胀线粒体基因组的存在。以上结果表明膨胀片段可能是细胞核DNA序列通过偶然的水平转移事件而整合到线粒体基因组中的,且该种膨胀方式的发生概率极低。本文报道的膨胀线粒体基因组为日后动物线粒体基因组学的研究提示了一种独特的变异方式。