三种农田土壤中氨氧化细菌amoA基因多样性比较分析

编号 zgly0001433999

文献类型 期刊论文

文献题名 三种农田土壤中氨氧化细菌amoA基因多样性比较分析

作者 汪峰  曲浩丽  丁玉芳  孙波  崔中利  曹慧 

作者单位 南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室  南京农业大学资源与环境科学学院  中国科学院南京土壤研究所  中国科学院研究生院 

母体文献 土壤学报 

年卷期 2012年02期

年份 2012 

分类号 S154.3 

关键词 氨氧化细菌  amoA基因  RFLP分析  农田土壤  微生物多样性 

文摘内容 比较分析中国东部不同季风气候区中海伦黑土(HL)、封丘潮土(FQ)和鹰潭红壤(YT)3种土壤氨氧化细菌amoA基因多样性。采用非培养方法直接从土壤中提取微生物总DNA,用氨氧化细菌amoA基因特异引物扩增总DNA,构建了3种土壤amoA基因文库,并对文库进行限制性长度多态性(RFLP)分析。HL、FQ和YT的amoA基因文库克隆数量分别为49、50和48个,相应的RFLP类型数为10、10和14个OTUs,其中有4个OTUs为三种土壤共有;YT中氨氧化细菌amoA基因多样性指数最高,FQ最低;HL和FQ群落的相似为70%,HL与YT的相似度为50%,而FQ和YT之间仅为42%,说明氨氧化细菌具有地理分布的规律:17个amoA基因序列可以被聚成6个cluster,分属Nitrosospira和Nitrosomonas两个属。三种农田土壤中均存在丰富的氨氧化细菌,表明氨氧化细菌在农田土壤氮素循环中具有重要作用。