犬瘟热病毒AH株全基因组序列测定及其分子特征

编号 zgly0001541727

文献类型 期刊论文

文献题名 犬瘟热病毒AH株全基因组序列测定及其分子特征

作者 刘柱  李丹丹  李琦  宫晓华  缪秋红  李传峰  陈宗艳  张淼涛  刘光清 

作者单位 中国农业科学院上海兽医研究所  西北农林科技大学动物医学院  甘肃农业大学动物医学院  安徽农业大学动物科技学院 

母体文献 中国动物传染病学报 

年卷期 2017年02期

年份 2017 

分类号 S852.659.5 

关键词 犬瘟热病毒  全基因组  序列分析 

文摘内容 本研究对犬瘟热病毒(Canine distemper virus,CDV)安徽分离株(CDV-AH株)的全基因组序列进行了测定和分析。根据GenBank上已发表的部分CDV基因组全长序列设计了8对特异性引物,RT-PCR方法分段扩增出CDV-AH株的全基因组序列。采用DNAStar软件和MEGA软件对CDV-AH株与其他CDV毒株的基因序列进行了比对和分析,并绘制系统进化树。结果显示,CDV-AH株全长15 690 bp,编码6种结构蛋白(N、P、M、F、H和L),与CDV-PS株核苷酸序列同源性最高,为98.8%,而与CDV-1以及Onderstepoort等疫苗株的序列同源性较低,为92.1%。CDV-AH株在保守区域出现15处氨基酸突变,这些突变对其所编码蛋白结构和功能的影响需要进一步研究。基于H基因序列的系统进化分析表明,CDV-AH株与其他CDV野毒株共同形成一个拓扑群,属于亚洲Ⅰ型。