基于MADS-box诱饵与蛋白质相互作用的拟南芥花瓣发育分子网络拓展

编号 zgly0001497002

文献类型 期刊论文

文献题名 基于MADS-box诱饵与蛋白质相互作用的拟南芥花瓣发育分子网络拓展

作者 杨黎  孙丛苇  代志军  何淼  袁哲明 

作者单位 湖南农业大学湖南省作物种质创新与资源利用重点实验室  湖南农业大学湖南省植物病虫害生物学及防控重点实验室  中山大学生命科学学院 

母体文献 植物学报 

年卷期 2015年05期

年份 2015 

分类号 Q945.4 

关键词 拟南芥  MADS-box  花瓣发育  蛋白质相互作用 

文摘内容 阐明花器官发育调控机理具重要的进化、发育和生态学意义。该文以拟南芥(Arabidopsis thaliana)花瓣发育为例,整合蛋白质互作、亚细胞定位、基因芯片和基因功能注释等数据库,通过组建蛋白质互作可信预测模型,获得拟南芥花瓣蛋白质互作网络,以含有MADS-box结构域蛋白为诱饵在网络中进行一级拓展,得到含38个蛋白质和67对互作的拓展网络。基于拓展网络,DAVID基因功能注释表明,多数蛋白质涉及的生物学过程与花发育调控相关;提取到19个候选四元互作,涉及ABCDE模型基因之外的8个基因,其中含MADS-box结构域的AGL16可能是B类基因新成员或其冗余;SEU、LUH、CHR4、CHR11、CHR17和AT3G04960为拟南芥花瓣AP1-AP3-PI-SEP四聚体的候选靶标基因。研究结果为深入解析拟南芥花瓣发育分子调控网络奠定了基础。