巨桉EXP基因家族的生物信息学分析

编号 zgly0001653545

文献类型 期刊论文

文献题名 巨桉EXP基因家族的生物信息学分析

作者 詹妮  谢耀坚  陈鸿鹏  刘果 

作者单位 国家林业局桉树研究开发中心 

母体文献 林业科学研究 

年卷期 2018年06期

年份 2018 

分类号 S792.39 

关键词 巨桉  EXP基因  生物信息学分析  表达模式 

文摘内容 [目的]本研究有助于了解EXP基因家族的基本特征,为深入研究其功能搭建平台。[方法]本研究对从巨桉(Eucalyptus grandis Hill)中筛选出35个EXP基因家族成员(Egr EXP1 Egr EXP35),利用生物信息学方法对其基因特征与表达模式进行综合分析。[结果]巨桉EXP基因分布在8条染色体之上,EXP蛋白均定位在细胞质膜上发挥作用,大多数的家族成员具有信号肽。巨桉EXP编码的蛋白质由α-螺旋、延伸链、无规卷曲、β-转角组成。进化分析结果表明,巨桉EXP蛋白与毛果杨(Populus trichocarpa) EXP蛋白的进化关系接近。35个巨桉EXP基因在巨桉未成熟木质部、成熟叶片、韧皮部、茎尖、木质部以及幼叶组织中表达模式存在显著差异。[结论]EXP基因家族各成员的表达模式不同,Egr EXP17、Egr EXP18可能在巨桉木材形成过程中起重要作用。