杉木纤维素合成酶类似蛋白基因ClCslD1的克隆及其生物信息学分析

编号 zgly0001414349

文献类型 期刊论文

文献题名 杉木纤维素合成酶类似蛋白基因ClCslD1的克隆及其生物信息学分析

作者 彭沙沙  童再康  黄华宏  周厚君  时剑  林二培 

作者单位 浙江农林大学林业与生物技术学院 

母体文献 浙江农林大学学报 

年卷期 2012年01期

年份 2012 

分类号 S791.27 

关键词 林木育种学  杉木  纤维素合成酶类似蛋白  克隆  表达 

文摘内容 纤维素合成酶类似蛋白(CSL)作为一种重要的膜蛋白与纤维素合成酶具有相类似的蛋白结构,都含有D,D,D,QXXRW保守区。利用其他物种中的CesA基因的保守序列设计简并引物,采用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)结合cDNA末端快速扩增技术(RACE)成功地从杉木Cunninghamia lanceolata中扩增出一个含有完整阅读框架的cDNA序列,长度为4 150 bp,开放阅读框架为3 396 bp,编码1 132个氨基酸并含有保守的D,D,D,QXXRW天冬氨酸残基序列。应用美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库对获得的基因进行序列分析比对,发现它属于CslD基因家族,命名为ClCslD1基因。多重序列比对结果分析表明,该蛋白与来自颤杨Populus tremuloides,水稻Oryza sativa,拟南芥Arabidopsis thaliana等的同源基因相似性高达71%以上。利用生物软件对其进行生物学分析,为进一步研究其在植物纤化中的功能奠定基础。