割手密SsREMO-1基因的克隆与等位变异分析

编号 zgly0001577168

文献类型 期刊论文

文献题名 割手密SsREMO-1基因的克隆与等位变异分析

作者 刘洋  姚艳丽  胡小文  徐磊  高玉尧  安东升 

作者单位 云南省甘蔗遗传改良重点实验室  中国热带农业科学院湛江实验站  广东省旱作节水农业工程技术研究中心 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年07期

年份 2018 

分类号 S566.1 

关键词 割手密  REMO基因  基因克隆  变异分析 

文摘内容 割手密抗逆基因资源的挖掘是甘蔗抗逆育种的重要工作任务。本研究以前期转录组测序得到的割手密REMO基因c DNA序列为探针,对Gen Bank中的EST数据库进行同源检索,发现高粱REMO基因（XM002465954.1）与其具有极高的相似性（94%）。利用高粱REMO基因（XM002465954.1）设计同源引物,后经PCR、分子克隆、序列分析验证成功分离了7个割手密REMO基因c DNA序列（Ss REMO-1a,Ss REMO-1b,Ss REMO-1c,Ss REMO-1d,Ss REMO-1e,Ss REMO-1f,Ss REMO-1g,Gen Bank登录号为MF095088-MF095094）。7条序列全长均为738 bp,5’非翻译区（UTR）长度78 bp,3’UTR长度为96 bp,包含一个564 bp的开放读码框,编码187个氨基酸。分析表明此蛋白序列具有REMO保守结构域。Ss REMO-1a、Ss REMO-1b、Ss REMO-1c、Ss REMO-1d、Ss REMO-1e、Ss REMO-1f、Ss REMO-1g的相似性在98.9%99.7%之间,存在14个单核苷酸多态性（SNP）位点,4个氨基酸变异位点,蛋白相似性在98.4%100%之间。Ss REMO-1蛋白序列与高粱、水稻、玉米等物种具有较高的同源性,可分为两个亚类。