4种大戟科植物PMK基因家族的全基因组鉴定与分析

编号 zgly0001438400

文献类型 期刊论文

文献题名 4种大戟科植物PMK基因家族的全基因组鉴定与分析

作者 邹智  杨礼富  安锋  林位夫  王真辉  袁坤 

作者单位 中国热带农业科学院橡胶研究所  农业部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室 

母体文献 西南林业大学学报 

年卷期 2013年05期

年份 2013 

分类号 S718.4  Q943.2 

关键词 大戟科植物  全基因组  PMK基因家族  鉴定  分析 

文摘内容 甲羟戊酸-5-磷酸激酶(PMK)是甲羟戊酸(MVA)途径中的关键酶,其在ATP和Mg2+等二价金属离子的存在下可逆地催化甲羟戊酸-5-磷酸(MVAP)磷酸化从而形成甲羟戊酸-5-焦磷酸(MVAPP)。基于已公布的基因组和EST数据,对蓖麻、麻疯树、木薯和橡胶树4种大戟科植物的PMK基因进行系统鉴定,分析其基因结构与进化特征。结果表明,蓖麻、麻疯树、木薯和橡胶树分别含有1、1、1和2个PMK基因,所有基因均含有9个内含子。根据同源性,PMK基因可分为2类,I类广泛分布于绿色植物和部分古细菌、真细菌和真菌中,II类则为动物所特有;虽然绝大多数绿色植物都含有PMK,但基因组范围内的搜索却未能在单细胞的绿藻中找到其同源基因;在大多基因组已测序的物种中,PMK主要以单拷贝的形式存在,其中包括蓖麻、麻疯树和木薯,但在橡胶树中基因出现了加倍现象,这与玉米和杨树类似。基因表达谱分析显示,在叶片、花、II/III期胚乳、V/VI期胚乳和种子等组织中,RcPMK在II/III期胚乳中的表达丰度较高,叶片、种子和花次之,而在V/VI期胚乳中的表达丰度最低。