木薯MeAFP2-like基因的序列特征及表达分析

编号 zgly0001652446

文献类型 期刊论文

文献题名 木薯MeAFP2-like基因的序列特征及表达分析

作者 肖亮  尚小红  单忠英  曹升  曾文丹  严华兵 

作者单位 广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室  广西壮族自治区农业科学院经济作物研究所 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年20期

年份 2018 

分类号 S533  Q943.2 

关键词 木薯  MeAFP2-like基因  基因克隆  生物信息学分析  表达分析 

文摘内容 AFP2基因被认为是植物脱落酸（ABA）信号转导途径的一个重要组分。为了研究木薯中AFP2基因的分子功能,本研究从木薯品种‘新选048’中克隆到一个AFP2基因。结果表明,AFP2-like基因的编码区全长为1 113 bp,编码370个氨基酸,该基因编码的氨基酸符合AFP基因家族的序列特征,含有EAR、NINJAB和Jas等结构域,该基因被命名为MeAFP2-like。Blastn序列比对发现,MeAFP2-like氨基酸序列和橡胶树HbAFP2 （XP021636423）序列相似性最高,为91%;系统进化树分析发现MeAFP2-like与橡胶树HbAFP2,蓖麻RcAFP2聚为一支;荧光定量PCR结果表明,MeAFP2-like基因在根中表达量最高,在叶片中表达量居中,在茎秆中表达量最低。这些结果为进一步研究该基因的功能提供了帮助。