樟叶越桔CYP450基因片段克隆与家族分析

编号 zgly0001693836

文献类型 期刊论文

文献题名 樟叶越桔CYP450基因片段克隆与家族分析

作者 何芳  李国泽  丁勇  李雪  贾士霖  赵展平  赵平 

作者单位 西南林业大学云南省高校林木生物技术重点实验室  西南林业大学西南山地森林资源保育与利用教育部重点实验室 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2020年02期

年份 2020 

分类号 S663.9  Q943.2 

关键词 樟叶越桔(VacciniumdunalianumWight)  CYP450  基因克隆  基因家族  序列分析 

文摘内容 广泛存在于生物体内的CYP450具有参与多种内源物质的新陈代谢和解除外源化学物质毒害作用的功能。本研究基于RNA-Seq数据,应用RT-PCR技术首次从樟叶越桔中克隆获得21个CYP450基因cDNA片段。应用生物信息学技术对21个樟叶越桔CYP450基因进行相似性分析、功能注释、家族分类以及聚类分析,除2个基因的家族分类不明确外,其余所有基因被分属于10个不同的CYP450家族中,分别为:CYP71、CYP72、CYP76、CYP81、CYP82、CYP86、CYP94、CYP97、CYP734和CYP735。推测有10个基因参与脂肪族、芳香族碳的羟基化,4个基因参与植物激素细胞分裂素的合成与降解,3个基因参与脂肪酸的羟基化,2个基因参与萜类化合物的合成。而KEGG分析结果显示2个基因家族未知的樟叶越桔CYP450基因可能参与了K00327途径。21个樟叶越桔CYP450基因能成功地与24个拟南芥CYP450基因聚类到一起。值得关注的是有2个樟叶越桔CYP450基因CL75.Contig12A（9）和Unigene225702A（14）被归类到拟南芥所特有的CYP82家族中,分别属于CYP82D和CYP82G亚家族,这为研究CYP82基因家族新物种来源提供了参考。本研究结果为认识樟叶越桔细胞色素CYP450基因和家族分类提供了信息,为樟叶越桔CYP450功能研究提供了参考依据。