矢竹地下茎转录组测序及节间生长相关基因表达分析

编号 zgly0001555846

文献类型 期刊论文

文献题名 矢竹地下茎转录组测序及节间生长相关基因表达分析

作者 魏强  丁雨龙 

作者单位 南方现代林业协同创新中心南京林业大学竹类研究所 

母体文献 南京林业大学学报(自然科学版 

年卷期 2017年05期

年份 2017 

分类号 S795 

关键词 矢竹  转录组  基因表达  赤霉素  细胞壁  节间生长  高生长 

文摘内容 【目的】揭示竹子地下茎生长发育的分子机制。【方法】利用高通量转录组测序对矢竹含不同发育阶段节的地下茎转录组图谱进行了分析研究,并利用qRT-PCR对节间生长相关基因进行表达模式分析。【结果】共获得了11 976条平均长度为1 008 bp的单基因簇(unigenes)。NCBI注释显示,63.8%的单基因簇具有注释结果,其中16 254条unigenes被注释到137个KEGG(京都基因与基因组百科全书)代谢通路中。Map Man分析共获得了1 864个转录因子及603个激素代谢及信号转导相关单基因簇。在功能基因方面,共获得564个与细胞壁构建相关的代谢基因,其中92个与木质素合成相关。此外,对9个与赤霉素、细胞壁合成及细胞骨架组织相关的基因,通过实时荧光定量PCR,分析了它们在节间不同发育阶段的表达模式。结果显示:细胞壁、细胞骨架下游功能相关基因在矢竹地下茎节间快速生长阶段表达最高;而赤霉素合成及信号传导相关基因则在节间伸长起始阶段最高。【结论】矢竹地下茎生长发育受到从各类激素、转录因子到其下游功能基因等组成的复杂分子网络的协同调控。