牛枝子抗旱候选基因LpDREB的克隆与表达及单核苷酸多态性分析

编号 zgly0000803346

文献类型 期刊论文

文献题名 牛枝子抗旱候选基因LpDREB的克隆与表达及单核苷酸多态性分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 李静  袁虎威  李伟 

作者单位 北京林业大学林木育种国家工程实验室林木花卉遗传育种教育部重点实验室 

母体文献 林业科学 

年卷期 2012(6)

页码 40-46

年份 2012 

分类号 S718.46 

关键词 牛枝子  LpDREB基因  诱导表达  序列分析  单核苷酸多态性 

文摘内容 牛枝子为胡枝子属中最具耐旱特性的灌木树种,是研究基于单核苷酸多态性(SNP)水平的植物个体间耐旱差异机制的重要材料。以5个种源的天然牛枝子为材料,利用染色体步移技术克隆牛枝子抗旱候选基因LpDREB的全长序列,对LpDREB基因的结构和系统进化进行分析,研究LpDREB基因的组织及诱导表达规律,分析LpDREB基因的SNP分布和类型。研究结果表明: 克隆的牛枝子LpDREB基因cDNA片段全长为1611bp,具有957bp的开放阅读框,编码318个氨基酸,包含DREB基因所特有的DREBP/AP2保守区域。LpDREB基因同大豆GmDREB3基因的进化关系最近,但2个基因除保守区域外的其他区域相似性不高。牛枝子LpDREB基因受干旱胁迫诱导表达,在组织器官中的根部表达量最大,其次为叶片,茎中的表达量最少。在天然牛枝子群体中共检测到23个SNP位点,其中启动子及5＇端非编码区4个,编码区17个,3＇端非编码区2个;23个SNP中,12个属于转换,11个属于颠换;编码区内的17个SNPs位点中,9个属于同义突变,8个为非同义突变,同义突变与非同义突变的比值为1.1。研究结果为基于SNP水平的牛枝子抗旱候选基因的关联分析奠定基础。