毛竹bHLH转录因子的鉴定及其在干旱和盐胁迫条件下的表达分析

编号 zgly0001683579

文献类型 期刊论文

文献题名 毛竹bHLH转录因子的鉴定及其在干旱和盐胁迫条件下的表达分析

作者 徐秀荣  杨克彬  王思宁  高志民 

作者单位 国际竹藤中心竹藤资源基因科学研究所国家林业局/北京市竹藤科学与技术重点开放实验室 

母体文献 植物科学学报 

年卷期 2019年05期

年份 2019 

分类号 Q943.2  S795.7 

关键词 毛竹  bHLH基因家族  基因鉴定  胁迫  表达分析 

文摘内容 以毛竹(Phyllostachys edulis (Carr.) Lehaie)为材料,利用生物信息学方法,在基因组水平上对其bHLH基因家族成员进行鉴定和分析,并对不同组织中该基因的表达模式以及部分基因在干旱和高盐胁迫条件下的表达情况进行研究。结果显示:在毛竹中共鉴定出153个具有完整保守结构域的bHLH基因家族成员(PebHLH001～PebHLH153),这些基因内含子数量为0～14,其中137个基因的启动子均含有与干旱、盐胁迫相关的顺式作用元件; PebHLHs编码的蛋白长度为134～1401 aa; bHLH家族成员的系统进化分析结果表明,153个PebHLHs可被分为17个亚类,其中C亚类的成员数量最多,为42个;基于转录组数据的表达谱分析结果发现,有151个PebHLHs在毛竹不同组织和不同生长发育时期有不同程度的表达量;实时荧光定量PCR实验结果显示,在干旱和盐胁迫处理后,分别有14和13个PebHLHs基因的表达量上调,分别有2和3个表达量下调,但表达模式存在一定差异,说明他们在应答干旱和盐胁迫过程中可能发挥不同的作用。