棉花竹FsMyb1基因的生物信息学研究

编号 zgly0001412073

文献类型 期刊论文

文献题名 棉花竹FsMyb1基因的生物信息学研究

作者 彭桂莎  杨宇明  孙浩  张怀璧  王娟 

作者单位 西南林业大学国家林业局西南地区生物多样性保育重点实验室  云南省林业科学院  新西兰皇家植物与食品研究所 

母体文献 西部林业科学 

年卷期 2011年04期

年份 2011 

分类号 S795 

关键词 Myb基因  生物信息学分析  棉花竹  苯丙氨酸代谢 

文摘内容 以项目组已克隆并在GenBank中登记的棉花竹的FsMyb1基因(GU390881)序列为基础,利用生物信息学分析方法,对其编码的FsMyb1蛋白进行理化性质、分子结构、生物功能预测和分析。结果显示,棉花竹FsMyb1基因编码是一种亲水性蛋白质;无信号肽,无导肽,无跨膜结构域;亚细胞定位为细胞核;共有2个糖基化位点和21个磷酸化位点。二级结构包括无规则卷曲、α-螺旋、延伸链;三级结构的构象为α-helix/loop混合型构象,是典型的R2R3-Myb转录因子。同源比对和进化分析结果显示,FsMyb1蛋白与OsMyb等蛋白有很高的同源性。初步推测,FsMyb1蛋白可能是一类调节苯丙氨酸代谢,尤其是一种与调节次生细胞壁增厚和花青素生物合成功能相关的转录调节因子。