基于CATS法的江豚SNPs位点筛选

编号 zgly0000561537

文献类型 期刊论文

文献题名 基于CATS法的江豚SNPs位点筛选

作者 李树珍  万慧荣  杨光 

作者单位 南京师范大学生命科学学院江苏省生物多样性与生物技术重点实验室 

母体文献 动物学报 

年卷期 2008,54(4)

页码 719-724

年份 2008 

分类号 Q959.841  S828.2 

关键词 江豚  SNPs  CATS  DHPLC 

文摘内容 通过比较锚定序列示踪(Comparative Anchor Tagged Sequences，CATS)法，选择人、小鼠及其它哺乳动物中已知的5对CATS引物，通过PCR反应从江豚(Neophocaena phocaenoides)基因组中扩增出相应的DNA片段，结合变性高效液相色谱(Denaturing High Performance Liquid Chromatography，DHPLC)和DNA直接测序等技术，进行江豚单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms．SNPs)位点的筛选。通过不同个体同源序列的比对分析，发现其中的4个DNA片段具有多态性，共检测出7个SNPs传点，即大约每370bp出现1个SNPs。