杜氏盐藻psaB基因cDNA克隆及系统进化分析

编号 zgly0000505101

文献类型 期刊论文

文献题名 杜氏盐藻psaB基因cDNA克隆及系统进化分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 鲁照明  刘红涛  臧卫东  薛乐勋 

作者单位 郑州大学 

母体文献 广西植物 

年卷期 2007,27(2)

页码 224-230,235

年份 2007 

分类号 Q943 

关键词 杜氏盐藻  A2亚基  psaB  cDNA  简并引物 

文摘内容 根据真核生物莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)、Chlamydomonas moewusii及Chlorella vulgaris等光系统I反应中心蛋白psaB基因的氨基酸高度保守序列,设计一对简并引物,利用TRIzol试剂提取杜氏盐藻(Dunaliella salina)细胞的总RNA,通过RT-PCR,得到的一段长为1.8 kb左右的cDNA片段。PCR产物经T-A克隆并测序以及测序结果推导成氨基酸序列进行同源性比较,表明所克隆的1815bp序列为杜氏盐藻光系统I反应中心psaB基因的cDNA片段,GenBank收录号为AY820754.根据已经得到的psaB的核苷酸序列推导成氨基酸序列与一些已知物种的psaB氨基酸序列相比较,同源性分别为Chlamydomonas reinhardtii 92%,Chlamydomonas moewusii 91%,Chlorella vulgaris 86%,Mesostigma viride 85%,Physcomitrella patens subsp.Patens 85%,Nephroselmis olivacea 84%.此外,psaB密码子偏爱性分析表明: 杜氏盐藻psaB基因第三位密码子A和T的组成分别为35.7%和39.17%,而G和C分别为7.27%和17.85%,即杜氏盐藻psaB基因密码子的组成大多为NNA和NNT.根据psaB基因的特征,作者对绿藻门的50个物种的psaB基因作了进化分析,结果表明。杜氏盐藻与Haematocoecaceae中的大多数种类进化地位最为接近,这为更进一步弄清杜氏盐藻的遗传背景提供了理论依据。