一个新的家蚕转录相关锌带蛋白基因的克隆及序列分析

编号 zgly0001316001

文献类型 期刊论文

文献题名 一个新的家蚕转录相关锌带蛋白基因的克隆及序列分析

作者 冯姗  张耀洲 

作者单位 浙江大学生物化学研究所  浙江理工大学生物化学研究所 杭州310029  杭州310018 

母体文献 昆虫学报 

年卷期 2006年05期

年份 2006 

分类号 Q78 

关键词 家蚕  锌带蛋白基因  电子克隆  基因克隆  序列分析 

文摘内容 锌带蛋白(zinc ribbon protein )是锌指类蛋白的一种,它的Cys4 Zn(2 +)结合位点由3个β2片层折叠而成,而不是α螺旋结构。锌带结构与锌指结构同为转录因子结合核酸的结构域,锌带蛋白作为转录相关因子在调节基因表达活性等方面具有重要作用。在对家蚕Bombyx mori蛹cDNA文库测序中,发现一个新的编码家蚕锌带蛋白基因的EST序列(GenBank登录号DY230964) ,以此序列为信息探针检索家蚕EST数据库,通过同源筛选,获得一个新的家蚕锌带蛋白基因cDNA全序列并经RT-PCR检测和克隆、测序验证,结果表明与电子克隆序列完全一致。我们将其命名为BmZNRD1(Zinc Ribbon Domain Containing 1)(GenBank登录号DQ432055)。该基因全长为675 bp,由363 bp的开放阅读框序列(ORF)、10 bp的5′端非翻译区序列(5′UTR)和302 bp的3′端非编码区序列(3′UTR)组成,其编码的120个氨基酸序列与其他真核生物间具有较高的同源性(达60 %左右) ,预测分子量为13·54 kD,等电点为6·8。BmZNRD1编码的氨基酸序列是一种锌带蛋白,推测有2个功能结构域,分别是位于N-端的Cx2Cx14Cx2C和C-端的Cx2Cx24Cx2C,其中C-端保守氨基酸序列Cx2Cx6Yx3QxRSADEx2TxFx2Cx2C在生物进化中保守性很高,从酵母、果蝇、线虫到两栖类、哺乳类都有发现该结构域的存在,与酵母RNA聚合酶A亚单位9和转录相关蛋白有很高的相似性,推测其具有相同的功能。将BmZNRD1基因cDNA序列与家蚕基因组序列进行比对,结果表明该基因具有3个外显子,2个内含子,外显子/内含子边界符合经典的GT-AG规则。