毛皮动物肺炎克雷伯菌Ⅲ型菌毛A基因克隆测序与生物信息分析

编号 zgly0000998213

文献类型 期刊论文

文献题名 毛皮动物肺炎克雷伯菌Ⅲ型菌毛A基因克隆测序与生物信息分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 钟世勋  迟珊珊  王振  姜晓东  刘丽萍  邵明旭  王传文  于翠莲  朱瑞良 

作者单位 山东农业大学动物科技学院/山东省动物生物技术与疫病防治重点实验室 

母体文献 中国兽医学报 

年卷期 2015(1)

页码 74-80

年份 2015 

关键词 肺炎克雷伯菌  MrkA基因  二级结构  B细胞抗原表位预测 

文摘内容 根据GenBank中肺炎克雷伯菌Ⅲ型菌毛结构基因A(MrkA)JF759921的序列设计1对引物,对8株毛皮动物肺炎克雷伯菌进行克隆测序,并应用生物信息学相关软件和方法,预测MrkA蛋白二级结构和B细胞抗原表位。PCR扩增出了609bp的目的基因片段,生物信息分析结果显示其开放阅读框架为609bp,编码202个氨基酸;二级结构以无规卷曲为主,有少量的α-螺旋和β-片层,少见β-转角,推测MrkA蛋白有8个B细胞优势抗原表位区域。结果表明,MrkA基因较稳定,其在进化过程中并未发生明显变异,为进一步分析肺炎克雷伯菌免疫机理、制备单克隆抗体和设计表位疫苗等奠定理论基础。