基于TMT质谱分析技术筛选水稻根尖响应汞胁迫差异表达蛋白

编号 zgly0001671376

文献类型 期刊论文

文献题名 基于TMT质谱分析技术筛选水稻根尖响应汞胁迫差异表达蛋白

作者 祁忠达  韦艳  龙水庭  代佑罡  仇广乐 

作者单位 贵州医科大学公共卫生学院职业卫生与环境卫生学系  贵州医科大学环境污染与疾病监控教育部重点实验室  中国科学院地球化学研究所环境地球化学国家重点实验室 

母体文献 生态学杂志 

年卷期 2019年06期

年份 2019 

分类号 S511  X173 

关键词 水稻  蛋白组学  TMT  PRM  汞胁迫 

文摘内容 稻米是人群汞暴露的最主要途径之一,为了从蛋白质水平上揭示水稻（Oryza sativa L.）适应重金属汞胁迫的分子机制,本研究以拔节期金优431水稻品种为材料,对比分析对照组和50、150、300 mg·kg-1氯化汞胁迫组,采用同位素相对标记与绝对定量TMT（Tandem Mass Tag）技术,结合定量蛋白质组平行反应监测（parallel reaction monitoring,PRM）技术,鉴定水稻根尖部位响应汞胁迫差异表达蛋白,对所获得差异蛋白进行生物信息学分析,从而筛选出汞胁迫响应显著的潜在靶标蛋白。同时,选择20个差异表达蛋白通过平行反应监测试验进行了蛋白验证。结果表明,在变化倍数≥1.3、P<0.05条件下,共鉴定5253种定量蛋白,包含364种差异蛋白,其中258种表达上调,106种表达下调。基因本体分子功能提示,这些差异性蛋白主要参与催化活性、绑定转运活性和抗氧化活性。京都基因与基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG）通路显著性富集于代谢途径、次生代谢产物生物合成、苯丙烷类生物合成等,错误发现率（false discovery rate,FDR）<0.05。成功鉴定并验证到的差异蛋白分别涉及抗氧化还原蛋白、金属螯合肽合成蛋白、金属硫蛋白相关蛋白等。差异表达蛋白中,与抗氧化、重金属胁迫防御响应和信号通路等相关的蛋白总体上调,而与代谢和能量产生与转运相关蛋白表达量总体下调。