丹参转录因子SmMYB7的克隆及表达模式分析

编号 zgly0000943414

文献类型 期刊论文

文献题名 丹参转录因子SmMYB7的克隆及表达模式分析

作者 朱小亚  崔璀  周宏骏  武玉翠  王喆之 

作者单位 药用资源与天然药物化学教育部重点实验室  西北濒危药材资源开发国家工程实验室  陕西师范大学生命科学学院 

母体文献 基因组学与应用生物学 

年卷期 2015(2)

页码 365-372

年份 2015 

关键词 丹参  SmMYB7  生物信息学分析  表达模式分析 

文摘内容 分析丹参转录组数据库(SRX021907),得到一条R2R3-MYB基因,blast比对发现该基因为丹参Sm MYB7(KF059361.1)。分别从g DNA和c DNA水平克隆该基因全长,测序结果表明该基因与公布序列一致,分析发现该基因无内含子序列,包含一个长为954 bp的开放读码框(ORF),编码317个氨基酸残基。多重序列比对和系统进化树分析显示Sm MYB7蛋白与拟南芥At MYB73同属R2R3-MYB第22个亚家族。已有丹参基因信息结合BD walking获得1 974 bp的启动子序列,分析结果表明多种顺式作用元件存在于该基因的启动子区。