草菇gpi基因结构及其异核体表达协同增效作用

编号 zgly0001397932

文献类型 期刊论文

文献题名 草菇gpi基因结构及其异核体表达协同增效作用

作者 刘朋虎  谢宝贵  邓优锦  陈炳智  贵甫  朱坚  江玉姬  刘新锐 

作者单位 福建农林大学菌物研究中心 

母体文献 食用菌学报 

年卷期 2011年04期

年份 2011 

分类号 S646.13 

关键词 葡萄糖-6-磷酸异构酶  基因结构  可变剪切  协同增效作用 

文摘内容 以草菇(Volvariella volvacea)单孢菌株PYd21(基因组测序菌株)和PYd15(基因组重测序菌株)为材料,配对获得可正常出菇的异核菌株H15-21。克隆测序了PYd21和PYd15的葡萄糖-6-磷酸异构酶基因(gpi),并对基因的结构和表达谱的表达量进行分析。结果表明,PYd21和PYd15的gpi基因序列相同;转录组reads定位、paired-end分析结果显示,gpi基因全长2404bp,ORF全长1659bp,编码552个氨基酸,含有8个外显子、7个内含子,5’UTR长度为101bp、3’UTR为183bp,RNA加工过程中有2种可变剪切类型、3个可变剪接位点;表达谱测序结果,PYd21、H15-21和PYd15 gpi基因的表达量分别为84.53、1079.31和270.95TPM,草菇gpi基因表达表现出异核体表达协同增效作用,暗示着异核菌株中的2种不同来源的细胞核可能存在相互作用,这一结果在实时荧光定量PCR检测后得到证实。