土壤中立枯丝核菌AG3菌核的荧光定量PCR快速检测

编号 zgly0001568235

文献类型 期刊论文

文献题名 土壤中立枯丝核菌AG3菌核的荧光定量PCR快速检测

作者 申永铭  郭成瑾  王喜刚  沈瑞清  陈爱昌  胡小平 

作者单位 西北农林科技大学植物保护学院旱区作物逆境生物学国家重点实验室  宁夏农林科学院植物保护研究所  甘肃定西市植保植检站 

母体文献 菌物学报 

年卷期 2017年10期

年份 2017 

分类号 S435.32 

关键词 实时定量PCR  水筛法  马铃薯黑痣病 

文摘内容 立枯丝核菌Rhizoctonia solani融合群3(anastomosis group 3,AG3)是引发马铃薯黑痣病的主要病原菌,严重威胁着马铃薯产业的发展。菌核是马铃薯黑痣病菌在土壤中的主要存活结构,是马铃薯黑痣病的初侵染源,其密度直接影响马铃薯黑痣病的发病率和严重程度。为快速准确地检测出土壤中菌核的密度,本研究以立枯丝核菌AG3转录间区(ITS)特异性引物RsTqF1/RsTqR1扩增产物的重组质粒为标准品,构建SYBR Green I实时定量PCR(q PCR)检测体系,结合水筛法与Fast DNA?Spin Kit for Soil土壤DNA提取试剂盒对土壤样品进行DNA提取,建立了循环域值(Ct)与土壤中立枯丝核菌AG3菌核密度的关系,并与传统选择性培养基筛选法进行比较。结果表明,实时定量PCR检测灵敏度比常规PCR高10倍,土壤中菌核密度n(g/g土)和Ct值之间的关系为:n=10(9.6917‐Ct)/3.4558。相比较于选择性培养基筛选法,水筛q PCR法能够更加快速准确地检测出土壤中立枯丝核菌的菌核密度。