极度濒危植物巧家五针松基因组微卫星特征分析

编号 zgly0001530593

文献类型 期刊论文

文献题名 极度濒危植物巧家五针松基因组微卫星特征分析

作者 阮桢媛  王兵益  欧阳志勤  廖礼彬  苏腾伟  乔璐 

作者单位 云南林业职业技术学院  中国林业科学研究院资源昆虫研究所  云南省环境科学研究院 

母体文献 植物研究 

年卷期 2016年05期

年份 2016 

分类号 S791.24 

关键词 巧家五针松  基因组  微卫星 

文摘内容 巧家五针松是世界极度濒危植物,对其SSR引物的开发有助于其遗传学研究以及物种的保护。本研究通过Illumina高通量测序技术获得巧家五针松全基因组序列,并以MISA软件查找得到2 651个微卫星序列,其中单核苷酸重复最多,可能预示了其悠久的进化历史。不同重复类型中,A/T含量显著高于G/C;在不同长度重复单元中,二核苷酸重复微卫星长度变异程度最高;各重复类型微卫星长度与微卫星出现的频率成反比。获得的微卫星序列能够满足巧家五针松的种群遗传学研究,而且反映了该物种的偏好性及对应的潜在功能,并且对该物种的保护提供了资料。