葡萄A病毒外壳蛋白基因克隆及分子变异分析

编号 zgly0001433935

文献类型 期刊论文

文献题名 葡萄A病毒外壳蛋白基因克隆及分子变异分析

作者 任芳  范旭东  董雅凤  张尊平  王教敏 

作者单位 中国农业科学院果树研究所  国家落叶果树脱毒中心  中华人民共和国葫芦岛出入境检验检疫局 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2012年05期

年份 2012 

分类号 S436.631.1 

关键词 葡萄A病毒  外壳蛋白基因  分子变异 

文摘内容 为获得葡萄A病毒(Grapevine virus A,GVA)外壳蛋白(CP)基因,并为开展GVA-CP介导的抗病毒转基因研究提供基础,本研究从葡萄休眠枝条中扩增获得12个GVA分离物的CP基因序列,全长597nt,编码198个氨基酸。所得分离物间核苷酸和氨基酸序列同源性分别为83.9%~99.8%和92.4%~99.5%,与GenBank中12个GVA CP序列比较,核苷酸和氨基酸序列同源性分别为71.0%~93.1%和81.8%~98.0%。系统进化分析表明,本研究12个分离物CP序列与已报道的GVA Ⅰ组亲缘关系最近。种群变异分析表明,GVA种群具有多种变异体类型,并且多个样品存在不同变异体类型的复合侵染。但绝大多数变异体克隆聚集在GVA Ⅰ组分支,有60%的克隆序列间同源性较高,并且聚集在同一个次级分支Ⅰ Aa,表明其为该GVA种群的优势序列。克隆的GVA CP基因以及优势序列群体的分析为葡萄抗病毒转基因研究奠定了基础。