杉木转录组SSR挖掘及EST-SSR标记规模化开发

编号 zgly0000955616

文献类型 期刊论文

文献题名 杉木转录组SSR挖掘及EST-SSR标记规模化开发

学科分类 220.5540;木材学

作者 文亚峰  韩文军  周宏  徐刚标 

作者单位 中南林业科技大学风景园林学院  中南林业科技大学林学院  广东省韶关市林业局 

母体文献 林业科学 

年卷期 2015(11)

页码 40-49

年份 2015 

关键词 杉木  微卫星标记  EST-SSR  转录组  序列从头拼接 

文摘内容 【目的】为解决杉木SSR标记数量不足、已开发的位点多态性较差等问题,以杉木转录组测序数据为基础,结合多重PCR技术批量挖掘SSR,规模化开发EST-SSR位点,为杉木分子遗传学研究奠定良好基础。【方法】杉木转录组序列数据(Accession:SRX151872)从NCBI的SRA数据库下载。利用CLC和CMi B软件批量挖掘SSR位点;利用四色荧光标记通用引物多重PCR(multiplex-PCR)技术实现SSR标记的规模化开发。