参与胡杨异形叶发生的长非编码RNA筛选、鉴定和功能分析

编号 zgly0001529060

文献类型 期刊论文

文献题名 参与胡杨异形叶发生的长非编码RNA筛选、鉴定和功能分析

作者 陆梦婷  周媛媛  吕建兵  王付康  温永强  秦少伟  赵利峰 

作者单位 塔里木大学生命科学学院  塔里木大学塔里木盆地生物资源保护利用重点实验室 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2016年11期

年份 2016 

分类号 S792.11 

关键词 长链非编码RNA  胡杨  异形叶  高通量RNA测序  生物信息学 

文摘内容 长非编码RNA(long non-coding RNA,lnc RNA)是真核生物中广泛存在的一类转录本超过200 nt不编码蛋白质的RNA,参与干细胞维持、胚胎发育、细胞分化、细胞生长、细胞凋亡、代谢、信号传导以及免疫应答等生理或病理过程的调控。本研究结合植物基因组特点以及高通量RNA测序数据,采用生物信息学手段建立并优化了一套植物lnc RNA筛选和鉴定的方法。利用此方法在胡杨异形叶发生的138 845个RNA-Seq测序数据中,筛选并鉴定了2 448个参与胡杨异形叶发生的lnc RNA,并进一步对其功能进行预测和分析,为研究胡杨异形叶生长发育特性及最终揭示叶形发育的分子机制提供资料和理论帮助。