海岛棉GAUT基因家族的鉴定及其在棉纤维发育中的表达分析

编号 zgly0001639710

文献类型 期刊论文

文献题名 海岛棉GAUT基因家族的鉴定及其在棉纤维发育中的表达分析

作者 张松雨  刘正文  张艳  杨君  马峙英  王省芬 

作者单位 教育部华北作物种质资源重点实验室/河北省作物种质资源重点实验室/河北农业大学 

母体文献 植物遗传资源学报 

年卷期 2018年04期

年份 2018 

分类号 S562 

关键词 海岛棉  半乳糖醛酸转移酶  生物信息学  纤维发育  基因表达 

文摘内容 本研究鉴定了海岛棉全基因组中的GAUT基因家族,对其进行了生物信息学及纤维发育过程中的表达分析。结果表明,海岛棉GAUT家族包含37个成员,分为3个亚组,分布在海岛棉18条染色体上。GAUT氨基酸序列保守基序有4个,保守性较强,所有GAUT蛋白均定位在高尔基体膜。根据GAUTs在海岛棉纤维发育不同时期的表达变化,将其分为起始期高表达、纤维伸长期高表达、次生壁增厚期高表达、全时期低表达等4类模式。其中,GAUT05、GAUT06、GAUT07、GAUT23、GAUT24、GAUT26等在纤维发育某个时期具有优势表达的基因可能在纤维发育过程中发挥着重要作用。上述结果为研究海岛棉GAUT基因家族在棉纤维发育中的功能提供了参考依据。