越橘属植物EST-SSR分子标记开发及遗传多样性分析

编号 zgly0001577846

文献类型 期刊论文

文献题名 越橘属植物EST-SSR分子标记开发及遗传多样性分析

作者 孙海悦  郭瑞雪  徐鉴  田友文  董梅  董坤  李亚东 

作者单位 吉林农业大学园艺学院 

母体文献 植物生理学报 

年卷期 2018年03期

年份 2018 

分类号 S663.9 

关键词 越橘  分子标记  EST-SSR  遗传多样性 

文摘内容 以84份越橘种质为材料,从NCBI公共数据库下载22 402条越橘属(Vaccinium)EST序列,通过CAP3组装软件将EST序列拼接成11 541条unigene序列,其中2 076条unigene序列含有2 679个SSR位点。二核苷酸和三核苷酸重复是主要的SSR类型,约占SSR总数的96.01%。利用Primer Premier 5.0软件设计81对引物,其中55对引物在供试越橘种质中扩增出理想的PCR产物,55对引物均有多态性。聚类分析结果显示,在遗传相似系数为0.70时,可以将供试越橘种质分成两大类。越橘EST-SSR标记可以用于种质鉴定与遗传多样性分析。