不同粗饲料条件下梅花鹿瘤胃甲烷菌结构的比较分析

编号 zgly0001527061

文献类型 期刊论文

文献题名 不同粗饲料条件下梅花鹿瘤胃甲烷菌结构的比较分析

作者 李志鹏  刘晗璐  司华哲  鲍坤  李光玉 

作者单位 中国农业科学院特产研究所经济动物研究室 

母体文献 动物营养学报 

年卷期 2016年09期

年份 2016 

分类号 S825.5 

关键词 梅花鹿  甲烷菌  Methanobrevibacter spp.  粗饲料 

文摘内容 本研究旨在基于高通量测序技术分析比较采食3种常见粗饲料梅花鹿瘤胃甲烷菌结构。选取3只2岁龄的装有永久性瘤胃瘘管的成年雄性梅花鹿为研究对象,采用3×3拉丁方设计,分别饲喂以柞树叶(OL组)、玉米秸秆(CS组)和玉米青贮(CI组)为主要粗饲料的饲粮。预试期为1周,正试期为4周。采用引物A519F、A976R扩增瘤胃甲烷菌16S rRNA基因V3~V4区,基于Illumina M iseq PE250平台进行测序。结果表明:9个样本共获得600 352条高质量的甲烷菌16S rRNA基因序列,基于97%相似性共归为111个分类操作单元(OTU)。覆盖度指数表明本试验样品覆盖了瘤胃99%的甲烷菌。分类分析结果表明甲烷短杆菌属(Methanobrevibacter spp.)[OL组:(97.80±6.00)%;CS组:(97.10±1.50)%;CI组:(87.50±5.50)%]是梅花鹿瘤胃优势甲烷菌,但采食3种粗饲料梅花鹿瘤胃甲烷菌在种水平的分布有差异。CI组Methanosphaera stadtmanae相对丰度显著高于OL组与CS组(P<0.05)。OL组与CI组Methanobrevibacter millerae相对丰度高于CS组(P>0.05),OL组与CS组Methanobrevibacter boviskoreani相对丰度高于CI组(P>0.05),而CS组与CI组Methanobrevibacter olleyae相对丰度高于OL组(P>0.05)。本研究发现Methanobrevibacter spp.是梅花鹿瘤胃优势甲烷菌。