东北地区3株猪细小病毒7型毒株基因组测定及遗传进化分析

编号 zgly0001652385

文献类型 期刊论文

文献题名 东北地区3株猪细小病毒7型毒株基因组测定及遗传进化分析

作者 张涵  解长占  李太元  哈卓  李卓昕  李成辉  李金凤  赵冠宇  郭影成  鲁会军  金宁一 

作者单位 军事医学科学院军事兽医研究所  延边大学农学院  吉林农业大学动物科学技术学院  吉林大学动物医学学院  吉林市丰满区动物疫病预防控制中心 

母体文献 中国动物检疫 

年卷期 2018年11期

年份 2018 

分类号 S852.651 

关键词 猪细小病毒7型(PPV7)  基因组测定  遗传进化分析 

文摘内容 从东北地区采集的150份猪肺脏样品中,检测出3株猪细小病毒毒株。根据PPV7标准株NCBI登录号KU563733设计3对引物,对3个病毒株的基因片段进行扩增测序,将测序结果依次进行拼接,获得3个病毒株的NS1和CP基因序列,然后进行序列的同源性比对及进化树分析。结果显示:3个毒株的NS1基因序列与经典PPV7毒株的同源性分别为94.4%～95.2%、94.1%～95.1%和93.5%～94.3%;CP基因序列与经典PPV7毒株的同源性分别为89.6%～91.8%、89.8%～92.0%和89.6%～91.7%。通过进化树比对分析,确认3株PPV毒株为PPV7亚型。通过对其他病毒进行检测,发现PPV7与PCV2、PPV2的混合感染率较高。该分析结果为我国东北地区猪病防控提供了依据。