基于SSR标记的川西南泡核桃良种DNA指纹图谱构建及聚类分析

编号 zgly0001645009

文献类型 期刊论文

文献题名 基于SSR标记的川西南泡核桃良种DNA指纹图谱构建及聚类分析

作者 周于波  朱鹏  龚伟  王景燕  闫思宇  吴开志  吴春艳  李海平  龚毅红  段琼 

作者单位 四川农业大学林学院林业生态工程四川省重点实验室  四川省林木种苗站 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年17期

年份 2018 

分类号 S664.1 

关键词 SSR标记  泡核桃  指纹图谱  聚类分析 

文摘内容 以川西南11个泡核桃优良品种资源为材料,利用SSR荧光标记技术进行了DNA指纹图谱构建和遗传关系分析。11对SSR荧光引物在11个泡核桃品种中共检测到59个等位基因,每个SSR位点有3~8个等位基因,平均为5.364个,有较好的多态性。期望杂合度(He)、香农信息指数(I)和多态信息含量(PIC)、变幅分别为0.579~0.851、0.993~1.972和0.490~0.833;均值分别为0.692、1.379和0.642。筛选出4对SSR引物wga004、wga032、wga070、zmz05为核心引物构建了各品种的指纹图谱。聚类分析中,11个泡核桃品种间遗传相似系数在0.525~0.932之间。说明11个泡核桃品种间遗传多样性较丰富,亲缘关系与选育的地理来源存在一定的相关性,地域上基因交流广泛,遗传背景复杂。