39种桉树微卫星序列的遗传多样性分析

编号 zgly0001566478

文献类型 期刊论文

文献题名 39种桉树微卫星序列的遗传多样性分析

作者 刘果  张党权  谢耀坚  陈鸿鹏  罗建中  吴志华 

作者单位 国家林业局桉树研究开发中心  中南林业科技大学林业生物技术湖南省重点实验室经济林育种与栽培国家林业局重点实验室经济林培育与保护省部共建教育部重点实验室 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2017年09期

年份 2017 

分类号 Q943.2  S792.39 

关键词 桉树  SSR分子标记  微卫星多态性  遗传多样性  亲缘关系 

文摘内容 为进一步研究桉树微卫星跨种的相似性及长度多态性,从基因组DNA遗传变异的角度探讨各个桉树种间的遗传多态性程度,本研究选用2个扩增结果稳定,微卫星完整的SSR位点进行PCR产物直接测序,从DNA序列的层次上对39种桉树进行遗传多样性分析和微卫星多态性分析。从SSR位点的层次上进行遗传多样性分析发现,2个SSR位点Nei’s遗传多样性指数Hs平均为0.576,期望杂合度He平均为0.736,多态信息含量PIC平均为0.694,位点e SSR-GR124遗传多样性较高,位点g SSR-CA013序列相对更为保守。基于微卫星序列和侧翼保守序列的比对分析,微卫星重复次数的变化可能与属内各亚属间的分类相关性较大,微卫星序列的碱基替换可能与属间分类的相关性更大。由2个位点的综合序列进行相似性比较和系统发育树分析发现,位点e SSR-GR124和位点g SSR-CA013能够作为伞房属和桉属属间分类鉴定的依据。