黑木耳实时荧光定量PCR内参基因的筛选

编号 zgly0001715667

文献类型 期刊论文

文献题名 黑木耳实时荧光定量PCR内参基因的筛选

作者 张越  姚方杰  孙文娟  方明  武春爽 

作者单位 吉林农业大学食药用菌教育部工程研究中心  吉林农业大学园艺学院 

母体文献 菌物学报 

年卷期 2020年08期

年份 2020 

分类号 S646.6 

关键词 候选内参基因  核糖核酸  互补DNA  不同菌株  不同生育期 

文摘内容 黑木耳Auricularia heimuer是我国主要栽培的食用菌之一,具有较高的经济价值和生态价值。本研究以黑木耳不同菌株(A14、A137和A12)和不同生育期的样品(菌丝体、原基和子实体)为实验材料,提取RNA,反转录成cDNA,在全基因组注释结果的基础上,选择12个候选内参基因(APRTase、β-TUB、RPL2、EF-1a、EF-2、PGI、PGM、H~+-ATPase、Tspd、TUB-1a、18S rRNA和28S rRNA)并设计跨内含子的引物,采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术进行扩增,利用geNorm、NormFinder、BestKeeper和ΔCt算法以及综合评价软件RefFinder,筛选适宜的内参基因。结果表明18S rRNA、β-TUB、EF1-a和28S rRNA适宜作为不同菌株的内参基因,APRTase、18S rRNA和28S rRNA适宜作为不同生育期的内参基因。