2个慈竹NAC转录因子的克隆与组织表达分析

编号 zgly0001530605

文献类型 期刊论文

文献题名 2个慈竹NAC转录因子的克隆与组织表达分析

作者 李会萍  黎帮勇  胡尚连  曹颖 

作者单位 西南科技大学植物细胞工程实验室  四川省生物质资源利用与改性工程技术研究中心 

母体文献 植物研究 

年卷期 2016年06期

年份 2016 

分类号 Q943.2  S795.5 

关键词 慈竹  NAC转录因子  克隆  生物信息学分析  组织表达模式 

文摘内容 以慈竹转录组数据为基础,结合毛竹基因组数据,采用同源克隆技术从慈竹中克隆到两个NAC基因Be NAC1(Gen Bank注册号:KU550706)和Be NAC2(Gen Bank注册号:KU821586),分别编码313和389个氨基酸残基。蛋白功能域预测和保守结构域多重对比分析表明,Be NAC1和Be NAC2基因均含有NAM保守域,其模拟的蛋白质三维结构与已知晶体结构的水稻模型蛋白高度相似。亚细胞定位预测分析显示,Be NAC1主要集中在细胞质中;Be NAC2则主要集中在细胞核中。表达分析表明,Be NAC1和Be NAC2具有相似的组织特异性表达,在茎中表达量均明显高于笋和叶片,且Be NAC1在除笋之外各组织中的表达量均显著高于Be NAC2。