拟南芥IQM2 cDNA的克隆与生物信息学分析

编号 zgly0001392314

文献类型 期刊论文

文献题名 拟南芥IQM2 cDNA的克隆与生物信息学分析

作者 陈羽中  周玉萍  叶蕙  桂林  郭培国  田长恩 

作者单位 广州大学植物抗逆基因功能研究广州市重点实验室  华南农业大学生命科学学院  广州大学生命科学学院 

母体文献 武汉植物学研究 

年卷期 2010年03期

年份 2010 

分类号 Q943.2 

关键词 拟南芥  生物信息学  IQM2  RACE 

文摘内容 拟南芥IQM2由At3g13600编码,是IQM家族的第二个成员,但在各种分子生物学相关的文献和数据库中都找不到其cDNA序列。本研究采用RACE和RT-PCR技术,克隆得到拟南芥IQM2基因的全长cDNA序列。该cDNA长2245 bp,其开放阅读框长1818 bp,编码1个由605个氨基酸残基组成的多肽链。生物信息学分析表明,IQM2蛋白含有一个IQ基序,属于钙不依赖性钙调素结合蛋白;其N端与豌豆重金属诱导蛋白6(HMIP6)有较高的同源性,而IQ基序则分布在HMIP6结构域内部;其C端与栝楼天花粉蛋白(trichosanthin)N端具有较高的同源性。