链状亚历山大藻共附生细菌多样性

编号 zgly0001353548

文献类型 期刊论文

文献题名 链状亚历山大藻共附生细菌多样性

作者 刘兵  李宇  叶倩  李太武  苏秀榕  李登峰  陈燕  史西志 

作者单位 宁波大学应用海洋生物技术教育部重点实验室  宁波海事局 

母体文献 生态学杂志 

年卷期 2009年05期

年份 2009 

分类号 Q938 

关键词 链状亚历山大藻  16S rDNA  RFLP  细菌多样性 

文摘内容 采用非分离培养分析方法,直接提取链状亚历山大藻(Alexandrium catenella)共附生细菌总DNA,以之为模板进行PCR扩增获得细菌16S rDNA基因片段,并构建16S rDNA克隆文库。通过16S rDNA限制性酶切片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)和测序方法对链状亚历山大藻共附生细菌的多样性进行了研究。84个16S rDNA克隆片段经限制性内切酶HaeⅢ酶切分析,得到30种不同的酶切指纹类型。挑选50个克隆子进行测序获得其16S rDNA部分序列,并对16S rDNA序列进行聚类分析构建了系统进化树。结果表明,链状亚历山大藻共附生的细菌多样性较强,优势细菌类群为变形菌α亚群(α-Proteobacteria)和拟杆菌(Bacteroidetes),其中玫瑰杆菌(Roseobacter sp.)在α-Proteobacteria中占绝对优势。