甘薯苯丙氨酸解氨酶基因IbPAL的克隆与表达分析

编号 zgly0001710805

文献类型 期刊论文

文献题名 甘薯苯丙氨酸解氨酶基因IbPAL的克隆与表达分析

作者 饶莉萍  苏文瑾  刘意  宋天晓  SoviguidiDekaReineJudesse  杨新笋  张文英 

作者单位 长江大学农学院  湖北省农业科学院粮食作物研究所  海南大学园艺学院 

母体文献 植物科学学报 

年卷期 2020年03期

年份 2020 

分类号 Q943.2  S531 

关键词 甘薯  IbPAL  克隆  qRT-PCR  亚细胞定位 

文摘内容 本研究基于甘薯(Ipomoea batatas(L.) Lam.)与绿原酸合成代谢相关的转录组数据克隆了苯丙氨酸解氨酶基因Ib PAL,通过蛋白序列比对、系统进化分析、二级和三维蛋白结构预测、跨膜结构域以及启动子分析,对该基因的氨基酸序列和启动子序列的结构特征进行了解析;通过qRT-PCR技术分析该基因在不同甘薯品种的根、茎、茎尖和叶中的表达情况,并对其进行亚细胞定位验证。结果显示,Ib PAL的CDS序列全长2130 bp,编码709个氨基酸。其氨基酸序列与已知物种的氨基酸序列同源性在80%以上。Ib PAL蛋白以α螺旋和随机卷曲为主,具有1个可能的跨膜螺旋区。该基因启动子中包含多个顺式作用元件。表达模式分析结果表明,Ib PAL主要在茎和茎尖中表达,其在甘薯品种‘EC16’4个组织器官中的表达量均显著高于其他品种。亚细胞定位结果显示该基因在细胞膜和细胞核上均可以表达。