紫竹不同栽培类型PPO基因片段克隆及其SNP分析

编号 zgly0001438547

文献类型 期刊论文

文献题名 紫竹不同栽培类型PPO基因片段克隆及其SNP分析

作者 肖国辉  王弋  娄永峰  林新春  郭小勤  方伟 

作者单位 浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室培育基地 

母体文献 浙江农林大学学报 

年卷期 2013年04期

年份 2013 

分类号 S795 

关键词 植物学  紫竹  PPO基因  单核苷酸多态性(SNP)  遗传多样性 

文摘内容 根据已报道的禾本科Poaceae植物PPO基因的保守序列(CuA和CuB区)设计1对引物,分别从紫竹Phyl-lostachys nigra 9个不同栽培变型中克隆到PPO基因片段。序列分析显示:9个序列彼此间核苷酸水平上一致性达到92.35%,氨基酸水平上的一致性达到81.83%。在某些栽培类型,一年紫和沟槽紫,该基因存在提前终止的现象。所获得的9条序列间存在明显的单核苷酸多态性(SNP)位点,多数位点引起非同义突变。根据所测得的序列对紫竹不同栽培类型的亲缘关系进行了遗传多样性分析。