全基因组预测枯草芽孢杆菌BEST195的分泌蛋白

编号 zgly0001504342

文献类型 期刊论文

文献题名 全基因组预测枯草芽孢杆菌BEST195的分泌蛋白

作者 任文来  韩长志  刘通  夏秀芹 

作者单位 廊坊市文安县农业局  西南林业大学云南省森林灾害预警与控制重点实验室 

母体文献 西南林业大学学报 

年卷期 2016年06期

年份 2016 

分类号 Q936 

关键词 枯草芽孢杆菌  分泌蛋白  信号肽  预测 

文摘内容 枯草芽孢杆菌BEST195作为纳豆菌的一种,是纳豆生产的重要菌株之一。利用Signal P、Prot Comp、TMHMM、Phobius、Lipo P、Tat P等预测程序对该菌中4 456条蛋白质序列进行分泌蛋白找寻,同时,对上述分泌蛋白的氨基酸分布、信号肽长度大小、信号肽切割位点等性质进行分析。结果表明:枯草芽孢杆菌含有分泌蛋白102个,其氨基酸长度、信号肽长度与植物病原菌不同;信号肽切割位点属于A-X-A类型,与其他已经报道的植物病原真菌、细菌以及卵菌中分泌蛋白信号肽切割位点一致。通过上述生物信息学分析方法有效地实现了枯草芽孢杆菌BEST195分泌蛋白的预测,分泌蛋白的信号肽切割位点具有物种保守型特点。