应用16SrDNA克隆文库解析苏铁珊瑚状根内生放线菌种群多样性

编号 zgly0001533970

文献类型 期刊论文

文献题名 应用16SrDNA克隆文库解析苏铁珊瑚状根内生放线菌种群多样性

作者 王国娟  曹妍  王芳  马焕成  郑艳玲  伍建榕 

作者单位 国家林业局西南地区生物多样性保育重点实验室  西南林业大学林学院云南省高校森林灾害预警控制重点实验室 

母体文献 中南林业科技大学学报 

年卷期 2016年08期

年份 2016 

分类号 S791.11  Q939.132 

关键词 苏铁  珊瑚状根  16S rDNA克隆文库  内生放线菌  种群多样性 

文摘内容 苏铁为古老孑遗植物,被誉为植物界的大熊猫和活化石。为了研究苏铁珊瑚状根内生放线菌的多样性,通过16S r DNA克隆文库开展了珊瑚状根内生放线菌种群多样性研究,从16S r DNA克隆文库中随机挑选了164个克隆子进行序列测定,对测序结果进行了Blast对比,结果表明,苏铁珊瑚状根中放线菌多样性十分丰富,存在5个目7个科10个属,主要类群为短小杆菌属Curtobacterium、利夫森氏菌属Leifsonia、考克氏菌Kocuria、鸟氨酸微菌属Ornithinimicrobium、微球菌属Micrococcus、丙酸杆菌属Propionibacterium、链霉菌属Streptomyces、拟诺卡氏菌属Nocardiopsis、芽球菌属Blastococcus;克隆得到的内生放线菌优势菌为短小杆菌属Curtobacterium,其次为拟诺卡氏菌属Nocardiopsis和链霉菌属Streptomyces。其中68株内生放线菌是能分离培养的,经16S r DNA片段测序分析,结果表明这些内生放线菌分别与Gen Bank中已知属相似性达97%~100%;其余的序列相似性低于97%,表明苏铁珊瑚状根中可能存在着放线菌新种。