基于高通量测序技术的美洲獾肠道微生物多样性分析

编号 zgly0001652049

文献类型 期刊论文

文献题名 基于高通量测序技术的美洲獾肠道微生物多样性分析

作者 王志永  吴晓阳  张永宾 

作者单位 石家庄市动物园管理处  曲阜师范大学生命科学学院 

母体文献 野生动物学报 

年卷期 2018年04期

年份 2018 

分类号 Q95  Q93 

关键词 美洲獾  肠道微生物  高通量测序  16SrRNA 

文摘内容 采用高通量测序技术对5只美洲獾的新鲜粪便进行测序,并进行生物信息学分析。结果表明:(1)测序获得高质量的140922条原始序列,平均序列为(27964±757)条,并归类于80个OTUs;(2)所有样品共含有10个菌门,74个菌属。其中,核心菌门5个,分别是厚壁菌门(73. 01%)、拟杆菌门(9. 31%)、变形菌门(7. 44%)、放线菌门(3. 08%)和疣微菌门(1. 66%);核心菌属21个,占样品微生物总量的47. 45%,此外,未分类的菌属占微生物总量的39. 18%。由此可见,美洲獾肠道微生物群落复杂,但主要菌群相对稳定,为进一步研究美洲獾肠道菌群结构与功能提供了参考依据。