利用RNA-Seq技术筛选不同海拔地区山羊转录组SNP

编号 zgly0001423281

文献类型 期刊论文

文献题名 利用RNA-Seq技术筛选不同海拔地区山羊转录组SNP

作者 姚娜  张文广  张兵  赵倩君  左清清  董坤哲  冯爱琴  马月辉 

作者单位 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所  内蒙古农业大学动物科学学院  中国科学院北京基因组研究所所级中心  云南农业大学动物科学技术学院 

母体文献 中国草食动物科学 

年卷期 2012年S1期

年份 2012 

分类号 S827 

关键词 RNA-Seq  山羊  转录组  SNP 

文摘内容 动物和人类的高海拔环境适应性机制和作用途径一直是生物学、医学和疾病学等领域研究者热衷探讨的课题之一,而从转录组水平对于西藏绒山羊的高海拔环境适应性研究仍未开展。以处于不同海拔地区的西藏班戈绒山羊和辽宁绒山羊为研究对象,利用RNA-Seq(RNA sequencing)技术,对其转录组进行测序,共筛选出153654个班戈绒山羊品种内SNP位点,154815个辽宁绒山羊品种内SNP位点,以及5 391个两品种间SNP位点,为从转录组水平对西藏班戈绒山羊高海拔环境适应性研究提供基础数据。