利用TRAP和SCAR标记评价铁皮石斛的遗传多样性与抗寒性

编号 zgly0001706539

文献类型 期刊论文

文献题名 利用TRAP和SCAR标记评价铁皮石斛的遗传多样性与抗寒性

作者 张君毅  吴永辉  刘嘉  秦建立  张轶钧 

作者单位 华侨大学生物工程与技术系 

母体文献 植物生理学报 

年卷期 2020年04期

年份 2020 

分类号 S567.239 

关键词 铁皮石斛  TRAP标记  抗寒性  遗传多样性  SCAR标记 

文摘内容 开发目标区域扩增多态性(TRAP)和特异序列扩增区域(SCAR)标记,对铁皮石斛(Dendrobium officinale)的3个生态类群46份种质进行遗传多样性评价、野生群体鉴别以及抗寒性筛选。以抗寒相关的CBF1/DREB1转录因子和钙依赖型蛋白激酶(CDPK1)基因设计TRAP固定引物,从57对TRAP引物中共筛选出21个引物组合,多态信息量(PIC)、分辨率(RP)和多态带百分比(PPB)平均分别为0.899、2.054和76.79%。Nei氏基因多样度(H)为0.217 7～0.291 7 (平均为0.258 1), Shannon信息指数(I)为0.325 1～0.442 1 (平均为0.389 2)。野生类群遗传多样性水平最高,仿野生类群和栽培类群基本一致。主成分分析(PCA)结果表明供试材料可分为野生和栽培两大类群。此外,开发了一个铁皮石斛转录因子(RAP2-4)的SCAR标记,并以该SCAR标记和TRAP固定引物共同筛选出了核心抗寒种质资源。本文研究策略拟为TRAP标记在育种中的应用提供参考。